Introduzione – Una base dati relativa al donatore cadavere, compilata durante il periodo 18/12/2004 – 05/08/2005 nell’ambito della fase di sperimentazione del Progetto “Strategie innovative per il trapianto di fegato (SITF): espansione del pool di organi adulti e pediatrici da donatore cadavere” [1], ha rivelato un tasso di completezza aggiustato pari al 76.64%. Tale riscontro è riconducibile sia alla necessaria stabilizzazione della dimensione concettuale e logico-fisica del database, sia alla modalità di realizzazione ed alla tempistica del data entry. Metodi – La base dati è stata trasformata in un insieme di variabili a codifica numerica binaria (0,1) mediante l’applicazione della funzione “IsMD(x) = 0” per i dati mancanti. La simulazione si è avvalsa di un’analisi originariamente condotta da Lindley su dati di Kalbfleisch circa la reazione di evitamento/apprendimento in un modello animale, assumendo per Y = 1 le risposte positive (successo) e per Y = 0 le risposte negative (fallimento), incorporando la probabilità di una risposta progressivamente migliorativa indotta dall’apprendimento per la probabilità di un fallimento [2]. Nel presente studio è stata introdotta l’assunzione di indipendenza degli utilizzatori (Users, n = 20), considerando l’equivalente di ogni atto di data entry (n = 61 per singolo utilizzatore) ad un Trial del modello di Lindley. Il modello è stato inserito nell’ambiente del software WinBUGS (Bayesian inference Using Gibbs Sampling) secondo l’appropriata sintassi. In seguito alla validazione sintattica del modello, il software WinBUGS ha abilitato le funzioni di caricamento dei dati, organizzati con estensione “.odc” e riconosciuti dal formato S-Plus attraverso l’istruzione “list”. La correttezza del modello e dei dati è stata ulteriormente verificata mediante l’istruzione di compilazione di WinBUGS. In seguito alla definizione dei valori di inizializzazione, il software ha quindi abilitato le funzionalità dei moduli “Update” e “Specification Tool”. Risultati – La trasformazione della base dati mediante la funzione “IsMD(x) = 0” per i dati mancanti ha generato un valore medio di 0.72+/-0.73. Un ciclo di 10000 update in WinBUGS (CPU: 1400MHz; RAM: 128MB) ha conseguito il raggiungimento della convergenza con adeguata kernel density estimation. Il nodo “Users” ha restituito il valore di 0.9338+/-0.0025 (MC error: 2.704-5), mentre il nodo “Trials” ha restituito il valore di 0.9992+/-0.0000546 (MC error: 6.908-6). Conclusioni – Il software WinBUGS costituisce un ambiente utile allo sviluppo di modelli di simulazione inerenti il profilo di completezza delle procedure di data entry in basi dati di interesse trapiantologico. Bibliografia - [1]. Santori G, Andorno E, Valente R et al. Transplant Proc 37:2415-2416 (2005). [2]. Spiegelhalter D. et al. Dogs: loglinear model for binary data. In: BUGS Examples vol 1. WinBUGS User Manual. Version 1.4. January 2003. Imperial College & MRC, UK.

Sviluppo di un modello bayeseano di simulazione inerente il profilo di completezza di una base dati di interesse trapiantologico nell’ambiente WinBUGS (Bayesian inference Using Gibbs Sampling).

SANTORI, GREGORIO;VALENTE, UMBERTO
2005-01-01

Abstract

Introduzione – Una base dati relativa al donatore cadavere, compilata durante il periodo 18/12/2004 – 05/08/2005 nell’ambito della fase di sperimentazione del Progetto “Strategie innovative per il trapianto di fegato (SITF): espansione del pool di organi adulti e pediatrici da donatore cadavere” [1], ha rivelato un tasso di completezza aggiustato pari al 76.64%. Tale riscontro è riconducibile sia alla necessaria stabilizzazione della dimensione concettuale e logico-fisica del database, sia alla modalità di realizzazione ed alla tempistica del data entry. Metodi – La base dati è stata trasformata in un insieme di variabili a codifica numerica binaria (0,1) mediante l’applicazione della funzione “IsMD(x) = 0” per i dati mancanti. La simulazione si è avvalsa di un’analisi originariamente condotta da Lindley su dati di Kalbfleisch circa la reazione di evitamento/apprendimento in un modello animale, assumendo per Y = 1 le risposte positive (successo) e per Y = 0 le risposte negative (fallimento), incorporando la probabilità di una risposta progressivamente migliorativa indotta dall’apprendimento per la probabilità di un fallimento [2]. Nel presente studio è stata introdotta l’assunzione di indipendenza degli utilizzatori (Users, n = 20), considerando l’equivalente di ogni atto di data entry (n = 61 per singolo utilizzatore) ad un Trial del modello di Lindley. Il modello è stato inserito nell’ambiente del software WinBUGS (Bayesian inference Using Gibbs Sampling) secondo l’appropriata sintassi. In seguito alla validazione sintattica del modello, il software WinBUGS ha abilitato le funzioni di caricamento dei dati, organizzati con estensione “.odc” e riconosciuti dal formato S-Plus attraverso l’istruzione “list”. La correttezza del modello e dei dati è stata ulteriormente verificata mediante l’istruzione di compilazione di WinBUGS. In seguito alla definizione dei valori di inizializzazione, il software ha quindi abilitato le funzionalità dei moduli “Update” e “Specification Tool”. Risultati – La trasformazione della base dati mediante la funzione “IsMD(x) = 0” per i dati mancanti ha generato un valore medio di 0.72+/-0.73. Un ciclo di 10000 update in WinBUGS (CPU: 1400MHz; RAM: 128MB) ha conseguito il raggiungimento della convergenza con adeguata kernel density estimation. Il nodo “Users” ha restituito il valore di 0.9338+/-0.0025 (MC error: 2.704-5), mentre il nodo “Trials” ha restituito il valore di 0.9992+/-0.0000546 (MC error: 6.908-6). Conclusioni – Il software WinBUGS costituisce un ambiente utile allo sviluppo di modelli di simulazione inerenti il profilo di completezza delle procedure di data entry in basi dati di interesse trapiantologico. Bibliografia - [1]. Santori G, Andorno E, Valente R et al. Transplant Proc 37:2415-2416 (2005). [2]. Spiegelhalter D. et al. Dogs: loglinear model for binary data. In: BUGS Examples vol 1. WinBUGS User Manual. Version 1.4. January 2003. Imperial College & MRC, UK.
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/11567/260520
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