Oggetto – Le informazioni relative ai donatori cadavere contenute in una base dati multicentrica compilata on-line durante il periodo 18/12/2004-05/08/2005 nell’ambito della fase di sperimentazione del Progetto “Strategie innovative per il trapianto di fegato (SITF): espansione del pool di organi adulti e pediatrici da donatore cadavere” sono state utilizzate per sviluppare un modello bayeseano di simulazione in merito alla completezza/appropriatezza del data entry. Metodi – La base dati è stata trasformata in un insieme di variabili a codifica numerica binaria (0,1) mediante l’applicazione della funzione “IsMD(x) = 0” per i dati mancanti. La simulazione si è avvalsa di un’analisi originariamente condotta da Lindley circa la reazione di evitamento/apprendimento in un modello animale, assumendo per Y = 1 le risposte positive (successo) e per Y = 0 le risposte negative (fallimento), incorporando la probabilità di una risposta progressivamente migliorativa indotta dall’apprendimento per la probabilità di un fallimento. Nel presente studio è stata introdotta l’assunzione di indipendenza degli utilizzatori (Users, n = 20), considerando l’equivalente di ogni atto di data entry (n = 61 per singolo utilizzatore) ad un trial. Il modello è stato inserito e validato nell’ambiente WinBUGS (Bayesian inference Using Gibbs Sampling) secondo l’appropriata sintassi. Risultati – La trasformazione della base dati mediante la funzione “IsMD(x) = 0” per i dati mancanti ha generato un valore medio di 0.72+/-0.73. Un ciclo di 10000 update in WinBUGS (CPU: 1400MHz; RAM: 128MB) ha conseguito il raggiungimento della convergenza con adeguata kernel density estimation. Il nodo “Users” ha restituito il valore di 0.9338+/-0.0025 (MC error: 2.704-5), mentre il nodo “Trials” ha restituito il valore di 0.9992+/-0.0000546 (MC error: 6.908-6). Conclusioni – Il software WinBUGS costituisce un ambiente utile allo sviluppo di modelli di simulazione inerenti il profilo di completezza delle procedure di data entry in basi dati di interesse trapiantologico. Bibliografia - 1. Santori G. et al. Transplant Proc 37:2415-2416 (2005). 2. Spiegelhalter D. et al. Dogs: loglinear model for binary data. In: BUGS Examples vol 1. WinBUGS User Manual. Version 1.4. January 2003. Imperial College & MRC, UK.

Applicazione di un modello bayeseano di simulazione del profilo di completezza di una base dati di interesse trapiantologico nell’ambiente WinBUGS (Bayesian inference Using Gibbs Sampling).

SANTORI, GREGORIO;VALENTE, UMBERTO
2006-01-01

Abstract

Oggetto – Le informazioni relative ai donatori cadavere contenute in una base dati multicentrica compilata on-line durante il periodo 18/12/2004-05/08/2005 nell’ambito della fase di sperimentazione del Progetto “Strategie innovative per il trapianto di fegato (SITF): espansione del pool di organi adulti e pediatrici da donatore cadavere” sono state utilizzate per sviluppare un modello bayeseano di simulazione in merito alla completezza/appropriatezza del data entry. Metodi – La base dati è stata trasformata in un insieme di variabili a codifica numerica binaria (0,1) mediante l’applicazione della funzione “IsMD(x) = 0” per i dati mancanti. La simulazione si è avvalsa di un’analisi originariamente condotta da Lindley circa la reazione di evitamento/apprendimento in un modello animale, assumendo per Y = 1 le risposte positive (successo) e per Y = 0 le risposte negative (fallimento), incorporando la probabilità di una risposta progressivamente migliorativa indotta dall’apprendimento per la probabilità di un fallimento. Nel presente studio è stata introdotta l’assunzione di indipendenza degli utilizzatori (Users, n = 20), considerando l’equivalente di ogni atto di data entry (n = 61 per singolo utilizzatore) ad un trial. Il modello è stato inserito e validato nell’ambiente WinBUGS (Bayesian inference Using Gibbs Sampling) secondo l’appropriata sintassi. Risultati – La trasformazione della base dati mediante la funzione “IsMD(x) = 0” per i dati mancanti ha generato un valore medio di 0.72+/-0.73. Un ciclo di 10000 update in WinBUGS (CPU: 1400MHz; RAM: 128MB) ha conseguito il raggiungimento della convergenza con adeguata kernel density estimation. Il nodo “Users” ha restituito il valore di 0.9338+/-0.0025 (MC error: 2.704-5), mentre il nodo “Trials” ha restituito il valore di 0.9992+/-0.0000546 (MC error: 6.908-6). Conclusioni – Il software WinBUGS costituisce un ambiente utile allo sviluppo di modelli di simulazione inerenti il profilo di completezza delle procedure di data entry in basi dati di interesse trapiantologico. Bibliografia - 1. Santori G. et al. Transplant Proc 37:2415-2416 (2005). 2. Spiegelhalter D. et al. Dogs: loglinear model for binary data. In: BUGS Examples vol 1. WinBUGS User Manual. Version 1.4. January 2003. Imperial College & MRC, UK.
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